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詳細情報

プロジェクト名 タンパク質機能解析関連データベースの統合化と成果普及事業
分野 ゲノムインフォマティックス
目的 NEDO事業「タンパク質機能解析・活用プロジェクト(平成12~17年度)」と「遺伝子多様性モデル解析プロジェクト(平成12~17年度)」の成果普及とバイオ情報基盤構築
紹介 NEDO事業「タンパク質機能解析・活用プロジェクト(平成12~17年度)」と「遺伝子多様性モデル解析プロジェクト(平成12~17年度)」の成果普及とバイオ情報基盤構築を目的として、構築した各種データベースの統合および公開を行う。本事業で統合・公開の対象としたデータベースは次の通りである。(1) 組織特異的転写物発現頻度データベース(iAFLP-DB)、(2) スプライシングバリアントデータベース(SV-DB)、(3) 遺伝子多様性データベース(H-GOLD)
キーワード ヒト|発現プロファイル
開始-終了年度 2006-2006
代表者 平川 登志行
代表者所属組織 産業技術総合研究所 バイオメディシナル情報研究センター
予算(百万円) 19.75
代表委託機関 バイオ産業情報化コンソーシアム
参加機関 バイオ産業情報化コンソーシアム|株式会社ダイナコム
論文等(PubMed ID) 調査中
特許(日本、海外) 調査中

成果物 (データベース、解析ツール)

H-Exp

要約 iAFLP によるヒト組織特異的転写物発現頻度データのDBで、H-InvDB と連携しています。本DBには3つの特徴があり、①表示対象遺伝子クラスター・アイソフォームの検索・参照・ソート、②遺伝子クラスター・アイソフォームに結び付けられた発現頻度パターンデータの比較、③遺伝子単位の発現情報の詳細情報をはじめとする各種関連情報の表示を高速に実行することが可能となっております。
主な対象データ 遺伝子発現

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