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<results country_code='ja' xmlns:collection='/collection.xml' xmlns='/lsdb_tree.xml'>
  <category name='MEDALS Catalog' node_url='http://cs14.dbcls.jp:1978/node/medals' id='medals'>
    <database title='LAST' url='http://last.cbrc.jp/' update_rate='33' id='69' mdate='2012/05/07' alias_name='なし'>
      <collection:specification data_type='DNA' data_volume='0.4' spec_class='Tool'>
        <collection:id_type id='None'/>
        <collection:related_id_type id='None'/>
        <collection:mol_type primary='yes' type='DNA-配列'/>
        <collection:mol_type type='　RNA'/>
        <collection:mol_type type='タンパク質'/>
        <collection:mol_type type='ユーザー任意のアルファベット'/>
        <collection:interface type='CUI（Charactor User Interface, またはコマンドライン）'/>
      </collection:specification>
      <collection:medals id='69' list_url='http://www.medals.jp/list/detail/69' site_image='http://medals.jp/images/thumnail/LAST.ja.jpg'/>
      <collection:input_example>入力はマルチファスタフォーマットの配列です。LASTのダウンロードには、examplesディレクトリに配列が幾つか入っています。</collection:input_example>
      <collection:method_download>http://last.cbrc.jp/archive/からソフトウェアをダウンロード</collection:method_download>
      <collection:resource name='なし'/>
      <collection:taxonomy primary='yes'/>
      <collection:taxonomy name='全生物種'/>
      <collection:operation country='日本'>
        <collection:organization name='産業技術総合研究所（AIST）　生命情報工学研究センター（CBRC）'/>
      </collection:operation>
      <collection:legal/>
      <collection:legal condition='GNU GPL'/>
      <collection:article>Adaptive seeds tame genomic sequence comparison. SM Kielbasa, R Wan, K Sato, P Horton, MC Frith, Genome Research 2011.  | Incorporating sequence quality data into alignment improves DNA read mapping. MC Frith, R Wan, P Horton, NAR 2010.  | Parameters for accurate genome alignment. MC Frith, M Hamada, P Horton, BMC Bioinformatics 2010.</collection:article>
      <collection:keyword word='ゲノム'/>
      <collection:keyword word='比較ゲノム'/>
      <collection:keyword word='配列タグマッピング'/>
      <collection:keyword word='spaced seeds'/>
      <collection:keyword word='サフィックスアレイ (suffix array)'/>
      <collection:keyword word='Vmatch'/>
      <collection:keyword word='X-drop アルゴリズム(algorithm)'/>DNAやタンパク質の配列アライメントを作成し、比較する大規模ゲノム配列比較ツールです。BLASTに似ていますが、大量のデータを扱うのに適しています。</database>
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