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| 成果物名 | LfDB |
|---|---|
| 成果物の別名 | レクチンフロンティアデータベース |
| 成果物に関する説明 | レクチンフロンティアデータベース(LfDB)は、蛍光検出を用いた自動化フロンタルアフィニティークロマトグラフィーシステム(FAC-FD、Fig. 1)を用いて取得した各種レクチンとピリジルアミノ化糖鎖間の結合定数を含む定量的相互作用データを格納しています。本方法で取得した相互作用データの精度、信頼性は非常に高いことから、LfDBは今後、広く生物学研究において貴重な情報源になると考えられます。（オリジナルサイトから） |
| 成果物のタイプ | DB |
| 運用機関 | 産業技術総合研究所（AIST） 糖鎖医工学研究センター（RCMG） |
| 機関所在国 | 日本 |
| サイトURL | http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/glycodb/LectinSearch |
| インターフェイス | GUI |
| 入力例 | 1: 適当なキーワードを入力してください。あるいは「Lectin family」「Monosaccharide Specificity」、「3D-fold」から適当なカテゴリを選択します。 すべてのレクチンリストを参照するためには、「全件表示」をクリックします。 （オリジナルサイトから） |
| キーワード |
自動化フロンタルアフィニティークロマトグラフィーシステム | レクチン | ピリジルアミノ化糖鎖
|
| ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 | - | なし |
| 使っている外部リソース | なし |
| 主な対象データ | 糖鎖 レクチン |
| 生物種 |
全生物種
|
| 利用条件 | 調査中 |
| データ更新頻度 (過去2年間) | 1 |
| 最終更新日（調査日） | 0000/00/00 (2009/02/04) |
| 利用できるID | なし |
| IDを使った成果物の利用方法 | 適用なし |
| 外部リンク | NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov) | Pfam (http://pfam.janelia.org) | PDB (http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do) |
| 論文等（PubMed ID） | [1] Kasai K, Ishii S. Quantitative analysis of affinity chromatography of trypsin. A new technique for investigation of protein-ligand interaction. J Biochem 1975; 77:261-4. [2] Hirabayashi J, et al. Oligosaccharide specificity of galectins: a search by frontal affinity chromatography. Biochim Biophys Acta 2002; 1572:232-54. [3] Hirabayashi J, et al. Frontal affinity chromatography as a tool for elucidation of sugar recognition properties of lectins. Methods Enzymol 2003; 362:353-68. [4] Nakamura-Tsuruta S, et al. Comparative analysis of carbohydrate-binding properties of two tandem repeat-type Jacalin-related lectins, Castanea crenata agglutinin and Cycas revoluta leaf lectin.. FEBS J 2005; 272:2784-99. [5] Tateno H, et al. Frontal affinity chromatography: sugar-protein interactions. Nat Protoc 2007; 2:2529-37. (オリジナルサイトから) |