詳細情報
| 成果物名 | miRRim |
|---|---|
| 成果物の別名 | なし |
| 成果物に関する説明 | miRRimは隠れマルコフモデル（HMM）をベースとしたmiRNA遺伝子の予測ツールです。このツールでは、miRNAの進化的、二次構造の特徴が多次元ベクトルシーケンスで表現されています。HMMsは配列の連続値を計算し、ベクトルシーケンスに利用されるモデルです。（オリジナルサイトから翻訳） |
| 成果物のタイプ | Tool |
| 運用機関 | 産業技術総合研究所（AISt） 生命情報工学研究センター(CBRC) |
| 機関所在国 | 日本 |
| サイトURL | http://www.ncrna.org/software/miRRim |
| インターフェイス | CUI（Charactor User Interface, またはコマンドライン） |
| 入力例 | perl ./miRRim.pl example/chr9_94011601_94111600_+.dat |
| キーワード | HMMs | miRNA |
| ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 | 4.2 | http://mirrim.ncrna.org/からプログラムをダウンロード |
| 使っている外部リソース | なし |
| 主な対象データ | RNA (miRNA) |
| 生物種 | 全生物種 |
| 利用条件 | 調査中 |
| データ更新頻度 (過去2年間) | 2 |
| 最終更新日（調査日） | 2010/04/23 (2010/05/10) |
| 利用できるID | - |
| IDを使った成果物の利用方法 | なし |
| 外部リンク | - |
| 論文等（PubMed ID） | 17959929 |