詳細情報
| 成果物名 | ASTRA |
|---|---|
| 成果物の別名 | 選択的スプライシング・選択的転写開始パターン分類データベース |
| 成果物に関する説明 | ASTRAは、ヒト、マウス、ハエ、線虫、シロイヌナズナ、イネに関する選択的スプライシング・選択的転写開始を自動検出し、パターンに従って分類したデータベースです。(オリジナルサイトから) |
| 成果物のタイプ | DB |
| 運用機関 | 産業技術総合研究所（AIST） 生命情報工学研究センター（CBRC） |
| 機関所在国 | 日本 |
| サイトURL | http://alterna.cbrc.jp/index.php |
| インターフェイス | GUI(JAVAアプレット) |
| 入力例 | サイト画面中央部検索ブルダウンメニューからSplicing Type”cassette”を選択して[Search!]ボタンをクリックします。 |
| キーワード | 選択的 | スプライシング | 転写開始パターン |
| ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 | - | なし |
| 使っている外部リソース | UniGene |
| 主な対象データ | DNA-配列 |
| 生物種 | 脊椎動物-哺乳類-ヒト 、マウス、ハエ、線虫、ナズナ、イネ |
| 利用条件 | 調査中 |
| データ更新頻度 (過去2年間) | 0 |
| 最終更新日（調査日） | 2005/01/01 (2009/01/21) |
| 利用できるID | なし |
| IDを使った成果物の利用方法 | なし |
| 外部リンク | Human genome resources | UniGene | ensembl |
| 論文等（PubMed ID） | [1] Nagasaki, H., Arita, M., Nishizawa, T., Suwa, M., and Gotoh, O. (2005) “Species-specific variation of alternative splicing and transcriptional initiation in six eukaryotes.” Gene, 364, 53-62. [2] Nagasaki, H., Arita, M., Nishizawa, T., Suwa, M., Gotoh, O. (2006) “Automated classification of alternative splicing and transcriptional initiation and construction of a visual database of the classified patterns.” Bioinformatics, 22 (10), 1211-1216. |