詳細情報
| 成果物名 | MXSCARNA |
|---|---|
| 成果物の別名 | MXSCARNA |
| 成果物に関する説明 | RNA配列のマルチプルアラインメントツールです。それぞれのRNA配列の塩基対確率行列を用いて、配列群の共通二次構造を考慮してアラインメントします。 |
| 成果物のタイプ | Tool |
| 運用機関 | 産業技術総合研究所（AIST） 生命情報工学研究センター（CBRC） |
| 機関所在国 | 日本 |
| サイトURL | http://mxscarna.ncrna.org/mxscarna/ |
| インターフェイス | GUI |
| 入力例 | RNA配列群を入力すると、マルチプルアラインメントと共通2次構造を表示する。 |
| キーワード | RNA | 共通2次構造 | マルチプルアラインメント |
| ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 | 2.5 | トップページから。 |
| 使っている外部リソース | なし |
| 主な対象データ | RNA （RNA配列） |
| 生物種 | 全生物種 |
| 利用条件 | 調査中 |
| データ更新頻度 (過去2年間) | 3 |
| 最終更新日（調査日） | 2007/11/24 (2009/02/03) |
| 利用できるID | - |
| IDを使った成果物の利用方法 | - |
| 外部リンク | - |
| 論文等（PubMed ID） | Yasuo Tabei, Hisanori Kiryu, Taishin Kin and Kiyoshi Asai: "A fast structural multiple alignment method for long RNA sequences," BMC Bioinformatics 2008, 9:33 |