詳細情報 XML output
| 成果物名 | LAST |
|---|---|
| 成果物の別名 | なし |
| 成果物に関する説明 | DNAやタンパク質の配列アライメントを作成し、比較する大規模ゲノム配列比較ツールです。BLASTに似ていますが、大量のデータを扱うのに適しています。 |
| 成果物のタイプ | Tool |
| 運用機関 | 産業技術総合研究所（AIST） 生命情報工学研究センター（CBRC） |
| 機関所在国 | 日本 |
| サイトURL | http://last.cbrc.jp/ |
| インターフェイス | CUI（Charactor User Interface, またはコマンドライン） |
| 入力例 | 入力はマルチファスタフォーマットの配列です。LASTのダウンロードには、examplesディレクトリに配列が幾つか入っています。 |
| キーワード |
ゲノム | 比較ゲノム | 配列タグマッピング | spaced seeds | サフィックスアレイ (suffix array) | Vmatch | X-drop アルゴリズム(algorithm)
|
| ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 | 0.4 | http://last.cbrc.jp/archive/からソフトウェアをダウンロード |
| 使っている外部リソース | なし |
| 主な対象データ | DNA-配列 RNA、タンパク質、ユーザー任意のアルファベット |
| 生物種 |
全生物種
|
| 利用条件 | GNU GPL |
| データ更新頻度 (過去2年間) | 33 |
| 最終更新日（調査日） | 2011/12/20 (2011/12/21) |
| 利用できるID | なし |
| IDを使った成果物の利用方法 | 適用なし |
| 外部リンク | なし |
| 論文等（PubMed ID） | なし |