詳細情報
| 成果物名 | GENIUS II |
|---|---|
| 成果物の別名 | なし |
| 成果物に関する説明 | 多重媒介配列検索法（MISS法）を用いて各生物種ゲノムの全ORFを構造既知のタンパク質の立体構造に帰属したデータベースシステムです。 |
| 成果物のタイプ | DB |
| 運用機関 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター |
| 機関所在国 | 日本 |
| サイトURL | http://genius.cbrc.jp/ |
| インターフェイス | GUI |
| 入力例 | 配列もしくはキーワードを検索テキストボックスに入力し、生物界を指定し、[Send]ボタンを押しす。 |
| キーワード | 配列アラインメント|Multiple Intermediate Sequence Search (MISS)|PDB|PSI-BLAST |
| ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 | 0 | 調査中 |
| 使っている外部リソース | 調査中 |
| 主な対象データ | タンパク質-配列 アミノ酸配列 |
| 生物種 | 全生物種 |
| 利用条件 | 調査中 |
| データ更新頻度 (過去2年間) | 1 |
| 最終更新日（調査日） | 2005/07/11 (2008/12/16) |
| 利用できるID | Gene name |
| IDを使った成果物の利用方法 | 調査中 |
| 外部リンク | 調査中 |
| 論文等（PubMed ID） | Asaf A.Salamov, Makiko Suwa, Christine A.Orengo and Mark B.Swindells, Combining sensitive database searches with multiple intermediates to detect distant homologues, Protein Engineering vol.12 no.2 pp.95-100, 1999 | ASAF A. SALAMOV, MAKIKO SUWA, CHRISTINE A. ORENGO and MARK B. SWINDELLS, Genome analysis: Assigning protein coding regions to three-domentional structures, Protein Science (1999), 8 :771-777. | Suwa, M., Salamov AA, Nishikawa, T. and Swindells, M. B. GoodMotif: The system for finding high quality motifs that can discriminate an unique family. Genome Informatics Series No8. 1997 8 : 342-343. | Yabuki, Y., Mukai, Y., Swindells, M. B. and Suwa M. | GENIUS II: a high-throughput database system for linking ORFs in complete genomes to known three-dimensional structures, Bioinformatics (2004), 20 :596-598. |