詳細情報

成果物名 GGDB
成果物の別名 GlycoGene DataBase
成果物に関する説明 糖鎖遺伝子は、糖転移酵素、糖ヌクレオチド合成酵素、糖ヌクレオチドトランスポーター、硫酸基転移酵素などのように、グリカン合成に関連している遺伝子を含んでいます。現在、180以上のヒト糖鎖遺伝子が同定されて、クローン作成され、特徴付けされています。 「糖鎖遺伝子ライブラリ作成プロジェクト」(2001年4月-2004年3月)において、基質特異性情報が格納された最初のデータベースである、糖鎖遺伝子データベース(GGDB)と同様に、私たちは糖鎖遺伝子に関するデータを収集し、編集しました。GGDBは、糖鎖遺伝子解析のために必要な情報を提供します。
成果物のタイプ DB
運用機関 産業技術総合研究所 糖鎖医工学研究センター
機関所在国 日本
サイトURL http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ggdb/
インターフェイス GUI
入力例 左のメニューから遺伝子(例:UGCG)を選ぶか、「キーワード検索」を選んで"UGCG"を入れて「検索」ボタンを押す。
キーワード 調査中
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 0.0 | なし
使っている外部リソース RefSeq | HUGO | EntrezGene | CAZy | MGI
主な対象データ DNA-配列 基質、発現
生物種 真核生物
利用条件 調査中
データ更新頻度 (過去2年間) 1
最終更新日(調査日) 2008 (2008/10/27)
利用できるID HUGO Gene Symbol | RefSeq ID | NCBI Gene ID | EC number | CAZy | MGI
IDを使った成果物の利用方法 http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/ggdb/Homolog?cat=symbol&symbol=[HUGO Symbol]
外部リンク 調査中
論文等(PubMed ID) 15467393