詳細情報
| 成果物名 | SGCAL |
|---|---|
| 成果物の別名 | Structural Glycomics Calculation |
| 成果物に関する説明 | SGCALは糖鎖のグリコシド結合断片化反応に着眼し、アノマー異性体、分岐およびイオン付加位置の解析を行い、実験によりMSで得られた質量スペクトルと計算結果を統合し、スペクトルを高速に同定するため網羅的な解析システムです。 |
| 成果物のタイプ | Tool |
| 運用機関 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター |
| 機関所在国 | 日本 |
| サイトURL | http://sgcal.cbrc.jp |
| インターフェイス | GUI |
| 入力例 | サイトURL画面上部検索テキストボックスに”Fuc”などの単糖をKEYWORDとして入力し、[Search]ボタンを押す。 |
| キーワード | 調査中 |
| ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 | 2 | なし |
| 使っている外部リソース | なし |
| 主な対象データ | 糖鎖 |
| 生物種 | 全生物種 |
| 利用条件 | 表示-非営利-改変禁止 |
| データ更新頻度 (過去2年間) | 0 |
| 最終更新日（調査日） | 2006/00/00 (2008/10/27) |
| 利用できるID | carbohydrate ID |
| IDを使った成果物の利用方法 | なし |
| 外部リンク | 調査中 |
| 論文等（PubMed ID） | Fukui, K.; Kameyama, A.; Mukai, Y.; Takahashi, K.; Ikeda, N.; Akiyama, Y.; Narimatsu, H., “A computational study of the structure-reactivity relationships in Na-adduct oligosaccharides in the collision-induced dissociation reactions”, Carbohydrate Research, 341, 624-633 (2006). |
| プロジェクト名 | 糖鎖エンジニアリングプロジェクト |
|---|---|
| 分野 | 健康バイオ |
| 目的 | 質量分析計におけるNa付加糖鎖の断片化反応メカニズムの解析ツール開発 |
| 紹介 | 平成15～18年度に実施した健康安心プログラム/糖鎖エンジニアリングプロジェクト/糖鎖構造解析技術開発，独立行政法人新エネルギー・産業技術総合開発機構の一環として開発した糖鎖解析ツールである。（参考：NEDO事後評価書 http://www.nedo.go.jp/iinkai/kenkyuu/bunkakai/18h/jigo/33/1/5-3.pdf ） |
| キーワード | 調査中 |
| 特許（日本、海外） | 調査中 |
| 成果物 (データベース、解析ツール) |