詳細情報

関連プロジェクト

成果物名 機能性RNA配列データベース
成果物の別名 fRNAdb
成果物に関する説明 fRNAdbは、既存のRNAデータベースから収集した既知及び予測RNAの配列情報と、機能性RNAプロジェクトで採取したものや予測したRNA配列情報を提供しています。 各配列には文献情報やゲノム上の位置、類似配列の情報などが関連付けられています。 強力なキーワード検索と相同性検索機能を提供しています。
成果物のタイプ DB
運用機関 産業技術総合研究所　生命情報工学研究センター
機関所在国 日本
サイトURL http://www.ncrna.org/frnadb/
インターフェイス GUI
入力例 検索欄に"miRNA"と入力し「submit」をクリックすると、マイクロRNAとそれに関連する配列一覧が得られます。 単語を追加するとより詳しい検索が可能です。例）"miRNA human" 精密な検索にはディレクティブを用います。例）"miRNA[so] human[org]"
キーワード 調査中
ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 53 | Downloadメニューをクリックしてダウンロード画面からダウンロード可能です。
使っている外部リソース RNAdb | Rfam | Gene Expression Omnibus | miRBase | NONCODE | H-invitational | snoRNA-LBME-db | European ribosomal RNA database
主な対象データ RNA
生物種 全生物種
利用条件 表示-継承
データ更新頻度 (過去2年間) 0
最終更新日（調査日） 2008 (2008/10/27)
利用できるID FR
IDを使った成果物の利用方法 http://www.ncrna.org/frnadb/detail.html?i_name=[ID]
外部リンク 調査中
論文等（PubMed ID） 18948287 | Mituyama T, Yamada K, Hattori E, Okida H, Ono Y, Terai G, Yoshizawa A, Komori T, Asai K. The Functional RNA Database 3.0: databases to support mining and annotation of functional RNAs. Nucleic Acids Res. 2008 Oct 23. [Epub ahead of print]

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プロジェクト名 機能性RNAプロジェクト
分野 ゲノムインフォマティックス
目的 バイオインフォマティクスの活用による機能性RNAを推定する技術の開発、機能性RNA解析のための支援技術・ツールの開発、および機能性RNAの機能を解析することにより、本研究分野における我が国の優位性の確立を目指します。(NEDO：機能性RNAプロジェクト：事業・プロジェクト概要(http://www.nedo.go.jp/activities/portal/gaiyou/p06011/p06011.html)より引用)
紹介 近年の研究により、我々哺乳類を含む高等生物の細胞中には、従来のタンパク質をコードするRNAとは異なり、タンパク質をコードしていないにもかかわらず転写されるnon-coding RNA（ncRNA：非コードRNA）が多数存在することが明らかになりました。これらは、機能性RNAとして、発生や細胞分化の過程において重要な役割を果たしており、がんや糖尿病などの疾患の発生にも深く関わっているものと考えられています。本プロジェクトでは、バイオインフォマティクスの活用による機能性RNAを推定する技術の開発、機能性RNA解析のための支援技術・ツールの開発、および機能性RNAの機能を解析することにより、本研究分野における我が国の優位性の確立を目指します。また、本プロジェクトにおける成果を素早く特許化することにより、将来的な医療・診断分野における新産業の創出に貢献します。(NEDO：機能性RNAプロジェクト：事業・プロジェクト概要(http://www.nedo.go.jp/activities/portal/gaiyou/p06011/p06011.html)より引用)
キーワード 機能性RNA｜non-coding RNA｜バイオインフォマティクス｜機能解析｜ツール開発
特許（日本、海外） 調査中
アーカイブ
機能性RNA プロジェクト 中間年報 (平成１８年度～平成２１年度)
成果物 (データベース、解析ツール) CentroidFold | Murlet | RNAmine | Rfold | 機能性RNAゲノムブラウザー