詳細情報 XML output

成果物名 Scarna
成果物の別名 なし
成果物に関する説明

ncRNA.org Projectの類似RNAの構造アラインメント、検索ツールです。

成果物のタイプ Tool
運用機関 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
機関所在国 日本
サイトURL http://www.scarna.org/scarna/
インターフェイス GUI
入力例

Web Services(トップページ中段のリンク、または上段のタグ)からRNAの二次構造予測、データベース検索、構造描写の機能を使える

キーワード
共通二次構造 | RNA | アラインメント
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 - | なし
使っている外部リソース 調査中
主な対象データ RNA
生物種
全生物種
利用条件 調査中
データ更新頻度 (過去2年間) 0
最終更新日(調査日) 0000/00/00 (2008/10/27)
利用できるID -
IDを使った成果物の利用方法 -
外部リンク

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論文等(PubMed ID)

Yasuo Tabei, Koji Tsuda, Taishin Kin and Kiyoshi Asai:

"SCARNA:Fast and Accurate Structural Alignment of RNA Sequences by Matching Fixed-length Stem Fragments," Bioinformatics Advance Access published on May 11, 2006. doi:10.1093/bioinformatics/btl182