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| 成果物名 | Scarna |
|---|---|
| 成果物の別名 | なし |
| 成果物に関する説明 | ncRNA.org Projectの類似RNAの構造アラインメント、検索ツールです。 |
| 成果物のタイプ | Tool |
| 運用機関 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター |
| 機関所在国 | 日本 |
| サイトURL | http://www.scarna.org/scarna/ |
| インターフェイス | GUI |
| 入力例 | Web Services(トップページ中段のリンク、または上段のタグ)からRNAの二次構造予測、データベース検索、構造描写の機能を使える |
| キーワード |
共通二次構造 | RNA | アラインメント
|
| ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | - | なし |
| 使っている外部リソース | 調査中 |
| 主な対象データ | RNA |
| 生物種 |
全生物種
|
| 利用条件 | 調査中 |
| データ更新頻度 (過去2年間) | 0 |
| 最終更新日(調査日) | 0000/00/00 (2008/10/27) |
| 利用できるID | - |
| IDを使った成果物の利用方法 | - |
| 外部リンク | - |
| 論文等(PubMed ID) | Yasuo Tabei, Koji Tsuda, Taishin Kin and Kiyoshi Asai: "SCARNA:Fast and Accurate Structural Alignment of RNA Sequences by Matching Fixed-length Stem Fragments," Bioinformatics Advance Access published on May 11, 2006. doi:10.1093/bioinformatics/btl182 |