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| 成果物名 | INOH Pathway Database |
|---|---|
| 成果物の別名 | なし |
| 成果物に関する説明 | ヒト、マウス、ラット等のモデル動物のパスウェイデータベースです。シグナル伝達パスウェイや代謝を構成する複層的生体分子の関係などの情報を含みます。（備考：BioPAX） INOH 2.5が2010年4月9日にリリースされました。 |
| 成果物のタイプ | DB |
| 運用機関 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター | 東京大学大学院 新領域創成科学研究科 |
| 機関所在国 | 日本 |
| サイトURL | http://www.inoh.org/ |
| インターフェイス | GUI | Client application |
| 入力例 | 調査中 |
| キーワード |
調査中
|
| ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 | 10.0 | http://www.inoh.org/download.htmlからファイルダウンロード |
| 使っている外部リソース | SWISS-PROT | Gene Ontology (GO) |
| 主な対象データ | タンパク質-プロテオーム |
| 生物種 |
ヒト、マウス、ラット、その他
|
| 利用条件 | 調査中 |
| データ更新頻度 (過去2年間) | 8 |
| 最終更新日（調査日） | 2011/01/06 (2011/01/14) |
| 利用できるID | 調査中 |
| IDを使った成果物の利用方法 | 調査中 |
| 外部リンク | 調査中 |
| 論文等（PubMed ID） | Fukuda, K. 2008. INOH pathway database: Curation, Annotation, Integration. InterOntology08, 1(1), pp.47-50 (2008). | Fukuda, K., Yamamoto, S., Sakai, N., Nakanishi, Y., Nakamura, H., Takagi, T.: "Graphical Syntax and Query for Pathway Database", The 10th World Multi-Conference on Systemics, Cybernetics and Infrmatics, pp7-10 (2006). | Tatsuya Kushida, Toshihisa Takagi, and Ken Ichiro Fukuda. 2006. Event Ontology: A Pathway-Centric Ontology for Biological Processes. Pacific Symposium on Biocomputing 11:152-163(2006). | Kushida, T., Yamamoto, S., Yamagata, Y., Asanuma, T., Hattori, E., Takagi, T. and Fukuda, K. 2005. Research on biological pathways peculiar to woody perennial Plants using a pathway database : P-INOH. Proceedings of International Workshop on Knowledge Discovery and Data Management in Biomedical Science. 2005.5, pp.56-67 | Fukuda, K. 2005. Higher Order Knowledge Proceeding : Pathway Database and Ontologies. Genomics & Informatics, vol.3, No.2, ISSN 1598-866X, 2005.6, pp.47-51 | Satoko Yamamoto, Takao Asanuma, Toshihisa Takagi and Ken Ichiro Fukuda. 2004. An Ontology for Annotation of Signal Transduction Pathway Molecules in the Scientific Literature: Molecule Role Ontology. Comparative and Functional Genomics, Volume 5, Issue 6-7, Pages 528-536 (2004). | Ken Ichiro Fukuda, Toshihisa Takagi. 2004. A Pathway Editor for Literature-based Knowledge Curation. APBC 2004, pp.339-344. | Ken Ichiro Fukuda, Yuki Yamagata, Toshihisa Takagi. 2004. Pathway Database: Higher Order Knowledge in Biology. Information Processing Society of Japan (IPSJ), Transactions on Databases, vol.45 No.SIG7(TOD 22) June 2004, pp.77-84 | Ken Ichiro Fukuda, Yuki Yamagata, Toshihisa Takagi. 2003. FREX: a query interface for biological processes with a hierarchical and recursive structures. In Silico Biol. 4, 0007 (2003). | Ken Ichiro Fukuda, Toshihisa Takagi. 2001. Knowledge Representation of Signal Transduction Pathways. Bioinformatics 2001. Vol.17, pp.829-837 |