詳細情報
| 成果物名 | CoCoozo |
|---|---|
| 成果物の別名 | なし |
| 成果物に関する説明 | CoCoozoはペプチド・タンデム質量分析向け並列高速サーチエンジンです。ピーク強度のパターンに相当するタンパク質配列を同定するために、MSスペクトルデータをクエリーとしてタンパク質配列データベースに対して高速な検索を行います。 |
| 成果物のタイプ | Tool |
| 運用機関 | 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター |
| 機関所在国 | 日本 |
| サイトURL | http://www.cbrc.jp/cocoozo/ |
| インターフェイス | GUI |
| 入力例 | 左部 "Search" タブより検索画面へ移動。入力ファイル(3種類のフォーマット)を指定し、パラメータを設定して"Submit"ボタンにより検索実行。サンプルのページも用意されています (http://www.cbrc.jp/cocoozo/sampleData.do?sampleName=1)。 |
| キーワード | 調査中 |
| ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 | 0 | なし |
| 使っている外部リソース | SwissProt | RefSeq |
| 主な対象データ | タンパク質-配列 |
| 生物種 | 全生物種 |
| 利用条件 | 表示-改変禁止 |
| データ更新頻度 (過去2年間) | 調査中 |
| 最終更新日（調査日） | 2003/06/30 (2008/10/22) |
| 利用できるID | UniProt ID | RefSeq ID |
| IDを使った成果物の利用方法 | 調査中 |
| 外部リンク | 調査中 |
| 論文等（PubMed ID） | 調査中 |