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関連プロジェクト

成果物名 VarySysDB
成果物の別名 なし
成果物に関する説明

VarySysDBは、ゲノム統合プロジェクトによって、H-Inv転写産物に関連付けられる形で注釈付けられたヒト多型情報を、公開する目的で作成されたデータベースです。つまり、転写領域やスプライス・サイト上の一塩基多型、挿入欠失多型、STR多型、単一アミノ酸多型、構造多型、連鎖不平衡領域について、それぞれH-InvDBの転写産物と機能ドメインに関連づけて、情報整備して公開しています。VarySysDBでは、個々の多型情報ごと及び転写産物ごとに整備された情報を、検索し表示ができる他、キーワードによる検索も可能になりました。検索した情報はダウンロードもできます。

成果物のタイプ DB
運用機関 産業技術総合研究所　バイオメディシナル情報研究センター
機関所在国 日本
サイトURL http://h-invitational.jp/varygene/home.htm
インターフェイス 検索サイト
入力例

トップ画面右上の入力フォームにHIX等を記入してGOボタンを押してください。
キーワード
調査中
ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 - | なし
使っている外部リソース H-InvDB | dbSNP
主な対象データ DNA-多型
生物種 脊椎動物-哺乳類-ヒト
利用条件 調査中
データ更新頻度 (過去2年間) 1
最終更新日（調査日） 2010/02/16 (2010/02/17)
利用できるID HIX(gene cluster) | HUGO Gene Symbol
IDを使った成果物の利用方法 調査中
外部リンク

調査中
論文等（PubMed ID）

調査中

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プロジェクト名 ゲノム情報統合プロジェクト
分野 ゲノムインフォマティックス
目的 # ヒト遺伝子の完全なカタログを作成 # H-InvDBを基礎としたアノテーション技術開発 # 疾患、遺伝子発現、タンパク質間相互作用など情報統合
紹介 本プロジェクトは、経済産業省のモデル事業として平成17年度から平成19年度までの3年間にわたり、バイオ産業情報化コンソーシアムを中心としてその他6つの共同研究機関が実施した。ヒト完全長cDNAを詳細にアノテーション（注釈付け）したH-Invitational Database（H-InvDB）を基礎として、その構築のための技術をさらに高度化し、世界最高水準のヒト全遺伝子データベースを構築して公開した。
キーワード ゲノム｜遺伝子｜アノテーション｜統合｜データベース
特許（日本、海外） JP2006323830(A) | JP2008097189(A)
アーカイブ
平成17年度-19年度 ゲノム情報統合プロジェクト に関する報告書
成果物 (データベース、解析ツール) Evola | G-compass | H-ANGEL | H-DBAS | H-Exp | H-InvDB | HEAT | LEGENDA | MDV | PPI view | TACT

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プロジェクト名 統合データベースプロジェクト
分野 ゲノムインフォマティックス
目的 これまでに経済産業省関連機関により実施された研究開発プロジェクトの成果等を整備することにより、ライフサイエンス分野における研究開発の促進に資するデータベースを構築することを目的とします。
紹介 経済産業省からの委託を受け、経済産業省関連機関により実施されたライフサイエンス分野の研究開発プロジェクトの成果であるデータベースに関する情報提供サイトを構築・運用します。また、ヒト遺伝子に関連した各種研究成果に関しては、平成17～19年度に実施したゲノム情報統合プロジェクトにおいて構築した、ヒト全遺伝子のアノテーション統合データベース (H-Invitational DB: http://www.h-invitational.jp/) を基礎として、経済産業省関連の研究成果を連携して利用できるシステムを構築します。
キーワード デ－タベ－ス｜解析ツ－ル｜成果物｜ポ－タル｜統合
特許（日本、海外） -
アーカイブ
平成20年度-22年度 産業技術研究開発「統合データベースプロジェクト」に関する報告書
成果物 (データベース、解析ツール) H-DBAS | H-InvDB | リンク自動管理システム | ID一括変換システム | LEGENDA | MEDALS | PMID-Extractor | PPI view | PubMedScan