詳細情報
| 成果物名 | ID一括変換システム |
|---|---|
| 成果物の別名 | ID Converter System |
| 成果物に関する説明 | ID一括変換システムは、リンク自動管理システムのデータを利用して、ヒト遺伝子とタンパク質に関係する世界の主要なデータベースのIDを相互に一括変換できるシステムです。詳細はこちらの解説を参照ください。 |
| 成果物のタイプ | Tool |
| 運用機関 | 産業技術総合研究所 バイオメディシナル情報研究センター |
| 機関所在国 | 日本 |
| サイトURL | http://biodb.jp/index.cgi?lang=jp#ids |
| インターフェイス | GUI | CGI |
| 入力例 | 変換元IDと変換先IDの種類を指定し、変換元のIDリストをテキストボックスに入力してSearchボタンを押す。変換元のIDリストはクライアントPC上のテキストファイルを指定することもできます。 |
| キーワード | 調査中 |
| ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 | 0.0 | 準備中 |
| 使っている外部リソース | DDBJ | EMBL | GenBank | H-InvDB | UniProt | PDB | HUGO |
| 主な対象データ | データ識別子（ID） |
| 生物種 | 脊椎動物-哺乳類-ヒト |
| 利用条件 | 表示-継承 |
| データ更新頻度 (過去2年間) | 730 |
| 最終更新日（調査日） | 2009/12/28 (2010/01/05) |
| 利用できるID | Accession Number | UniProt ID | PDB ID | HUGO Gene Symbol | HIX(gene cluster) | HIT(transcript) |
| IDを使った成果物の利用方法 | 調査中 |
| 外部リンク | 調査中 |
| 論文等（PubMed ID） | Imanishi T and Nakaoka H (2009) Hyperlink Management System and ID Converter System: enabling maintenance-free hyperlinks among major biological databases. Nucleic Acids Research 37 (Web Server Issue) (in press). |
| プロジェクト名 | 統合データベースプロジェクト |
|---|---|
| 分野 | ゲノムインフォマティックス |
| 目的 | これまでに経済産業省関連機関により実施された研究開発プロジェクトの成果等を整備することにより、ライフサイエンス分野における研究開発の促進に資するデータベースを構築することを目的とします。 |
| 紹介 | 経済産業省からの委託を受け、経済産業省関連機関により実施されたライフサイエンス分野の研究開発プロジェクトの成果であるデータベースに関する情報提供サイトを構築・運用します。また、ヒト遺伝子に関連した各種研究成果に関しては、平成17～19年度に実施したゲノム情報統合プロジェクトにおいて構築した、ヒト全遺伝子のアノテーション統合データベース (H-Invitational DB: http://www.h-invitational.jp/) を基礎として、経済産業省関連の研究成果を連携して利用できるシステムを構築します。 |
| キーワード | デ－タベ－ス｜解析ツ－ル｜成果物｜ポ－タル｜統合 |
| 特許（日本、海外） | - |
| 成果報告書 |
平成20年度 産業技術研究開発「統合データベースプロジェクト」に関する報告書 [PDF 4.8MB]
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| 成果物 (データベース、解析ツール) | Evola | G-compass | H-ANGEL | H-DBAS | H-Exp | H-InvDB | リンク自動管理システム | LEGENDA | MEDALS | PMID-Extractor | PPI view | PubMedScan | VarySysDB |
| 関連プロジェクト |