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関連プロジェクト

成果物名 MCG CNV Database
成果物の別名 なし
成果物に関する説明

本データベースは、日本人の健常者集団を対象として独自開発したBACアレイ（ MCGアレイ ）1) ならびにSNPアレイ (illumina, HumanOmniExpress Beadchip)を用いた解析を行い、 検出された CNVと LOHを収載したものです。このことにより、日本人健常者集団におけるCNVやLOHの出現頻度を示し、 ゲノム解析において検出されるゲノム変化が病態と関連するかどうかを判断するための基盤情報となります(オリジナルサイトより引用)。
成果物のタイプ DB
運用機関 東京医科歯科大学
機関所在国 日本
サイトURL http://www.cghtmd.jp/CNVDatabase/top!changeJaLocale
インターフェイス GUI
入力例

ステップ1.画面上部の[Data View]メニューをクリックする。

ステップ2.表示された染色体図の適切な個所をクリックする。
キーワード
調査中
More information More
CNV|BAC|MCG|SNP|de novo|家系|イルミナ
ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 0 | なし
使っている外部リソース Genesymbol|Refseq|Database of Genomic Variants
主な対象データ DNA-多型 アレイ
生物種
ヒト
利用条件 調査中
データ更新頻度 (過去2年間) 1回/1年
最終更新日（調査日） 2011/12/01 (2012/01/11)
利用できるID CloneID
IDを使った成果物の利用方法 http://www.cghtmd.jp/CNVDatabase/cnv-chrom-map.action#[CloneID]
外部リンク

UCSC(http://genome.ucsc.edu/)|NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)|Database of Genomic Variants(http://projects.tcag.ca)
論文等（PubMed ID）

15245590

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プロジェクト名 染色体解析技術開発
分野 バイオテクノロジー・医療技術分野
目的 近年ゲノム解析技術の進展により、数十万から数百万塩基対に及ぶゲノム染色体上の大規模な異常（増幅、欠失等）が存在し、癌や遺伝疾患などと密接に関係していることが解明され始め、診断分野への応用に対する期待が高まっている。 本プロジェクトでは、こうした染色体異常を高感度、高精度かつ迅速、安価でゲノム全領域にわたり検出するゲノムアレイや解析基盤技術および全自動解析システムの開発を行います。さらに、臨床情報を有する臨床サンプルを解析することにより、ゲノムアレイを用いた染色体異常解析技術の有用性の検証を行い、臨床現場で活用できるバイオ診断機器およびその基盤を開発することを目的としている。
紹介 具体的には、これまでの成果をさらに発展させ、癌や遺伝疾患などの臨床検体を用いた解析を進めるとともにヒトゲノム多型データベースを構築する。その成果に基づいて癌及び遺伝性疾患の診断に適したBAC DNAを選別し、それらを搭載した診断用ゲノムアレイを開発する。一方では、解析精度、再現性、簡便性を満たす臨床診断用全自動染色体異常解析装置の開発を行い、癌及び遺伝性疾患を診断するための染色体異常解析システムを確立する。そしてこれらを総合することにより、染色体異常の解析に基づいた癌及び遺伝性疾患の個別化医療を実現させるための基盤を構築する事を目的とする。
キーワード 染色体異常データシステム|個別化医療実現のために必要な日本人ゲノム多型のデータ収集と情報データベース構築
特許（日本、海外） JP20070323914 | JP2009103501(A) | JP2007002071 | JP20080138530 | JP2009284783(A) | JP2009284784(A) | JP20080138533 | JP20080172608 | JP2009240296(A) | JP2010022236(A) | JP2010035447(A) | JP2010035525(A) | JP2010063413(A) | JP2010151678(A) | JP2010099039 (A) | JP20080313336 | JP2010148426(A) | JP2010200675(A) | 12/153,342 | 12/126,637 | 12/128,46 | 12/153,967 | 12/219,508 | 2008009943.5 | 20008009927.8 | 200810108666.3 | 200810108639.6 | PCT/JP2008/072638
成果物 (データベース、解析ツール) CGH Data Base | Database of Genomic Variants