詳細情報

成果物名 JSNP DATABASE
成果物の別名 JSNP
成果物に関する説明 日本人一般集団786人を対象に遺伝子型の決定を行い、アレル(対立遺伝子)頻度のデータを第9回公開から提供しています。NEDOプロジェクトの成果(データ)が一部含まれています。
成果物のタイプ DB
運用機関 東京大学|JST
機関所在国 日本
サイトURL http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/index.html
インターフェイス GUI
入力例 サイトURL画面上部検索テキストボックスに”BRCA1”を入力して、[Search]ボタンを押す。
キーワード SNPs
ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 調査中 | http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/data_download_ja.htmlからファイルダウンロード
使っている外部リソース 調査中
主な対象データ DNA-多型 アレル(対立遺伝子)頻度
生物種 脊椎動物-哺乳類-ヒト
利用条件 Genotype頻度データのダウンロードにはアカウントが必要。
データ更新頻度 (過去2年間) 3回/1年
最終更新日(調査日) 2010/05/13(2010/05/17)
利用できるID JSNP ID
IDを使った成果物の利用方法 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/cgi-bin/SnpInfo.cgi?SNP_ID=[JSNP ID]
外部リンク 調査中
論文等(PubMed ID) 12436197 | 11752280 | 12426569

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プロジェクト名 標準SNPs解析
分野 調査中
目的 「標準SNPs解析事業」の目的は文部科学省の外郭団体であるJSTによって報告される15万SNPsについてのジェノタイプ(1億タイピング)を行い、日本人一般集団におけるアレル頻度のデータベースを構築した。(出典:成果報告書平成12年度より)
紹介 ゲノムインフォマティクス
キーワード SNPs|日本人|アレル頻度
特許(日本、海外) 調査中
成果物 (データベース、解析ツール)