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| 成果物名 | 大腸菌マルチオミクス データベース |
|---|---|
| 成果物の別名 | なし |
| 成果物に関する説明 | 高度に複雑化した自然界の生命科学を理解するには、包括的な知識として細胞内側の分子コンポーネントに関する定量的情報が必要です。日本の鶴岡市にある慶應義塾大学先端生命科学研究所においては、モデル生物の大腸菌のオミックスデータを集約するための共創的で壮大なチャレンジに尽力しています。(出典:オリジナルサイトより) |
| 成果物のタイプ | DB |
| 運用機関 | 慶応義塾大学 |
| 機関所在国 | 日本 |
| サイトURL | http://ecoli.iab.keio.ac.jp/ |
| インターフェイス | GUI |
| 入力例 | 画面中央の”Metabolome Data”欄の”Metaboleme data”メニューをクリックする。 |
| キーワード |
マルチオミックス | メタボローム | トランスクリプトーム | プロテオーム | フラクソミクス
|
| ダウンロードデータ総量(Mbyte) | データ一括取得方法 | 0.8 | http://ecoli.iab.keio.ac.jp/ からファイルダウンロード |
| 使っている外部リソース | 調査中 |
| 主な対象データ | 遺伝子発現 、タンパク質、代謝物質 |
| 生物種 |
微生物-大腸菌
|
| 利用条件 | なし |
| データ更新頻度 (過去2年間) | 2年以上なし |
| 最終更新日(調査日) | 2007/05/10( 2009/11/10 ) |
| 利用できるID | N/A |
| IDを使った成果物の利用方法 | なし |
| 外部リンク | G-language Project ( http://www.g-language.org/ ) | E-Cell Project ( http://www.e-cell.org/ ) | Human Metabolome Technologies, Inc.( http://www.humanmetabolome.com/ ) |
| 論文等(PubMed ID) | “Multiple high throughput analyses monitor the response of E. coli to perturbations” Ishii, N., Nakahigashi, K., Baba, T., Robert, M., Soga, T., Kanai, A., Hirasawa, T., Naba, M., Hirai, K., Hoque, A., Yee, Ho, Pei., Kakazu, Y., Sugawara, K., Igarashi, S., Harada, S., Masuda, T., Sugiyama, N., Togashi, T., Hasegawa, M., Takai, Y., Yugi, K., Arakawa, K., Iwata, N., Toya, Y., Nakayama, Y., Nishioka, T., Shimizu, K., Mori, H. and Tomita, M. Science 316 : 593-597 (2007) |
| プロジェクト名 | 生物機能を活用した生産プロセスの基盤技術開発 |
|---|---|
| 分野 | グリーンバイオ |
| 目的 | 化石資源に大きく依存した化学工業等の生産システムから、環境負荷の少ない省エネルギー・環境調和型循環産業システムへの変革の促進および、我が国バイオ産業の国際的競争力の維持、増進のため、化学プロセスを代表とする従来の物質生産プロセスに代替しうる、バイオプロセスの基盤的技術の開発を目的とする。(JBAサイトより) |
| 紹介 | 国家産業技術戦略(平成12年4月)においてバイオテクノロジー産業化の取り組みとして環境・工業プロセス分野の重要性が認識された後、本プロジェクトは、幅広い産業分野の企業経営者で設立された「グリーンバイオ戦略フォーラム」(平成11年設立)で検討され、日本新生プランの中で行われる環境バイオ推進のための「グリーンバイオイノベーションプログラム」の一環として、平成13年度からスタートした。実験および理論的手法を組合せ、生産目的に合わせて微生物を設計・改変し、物質生産を効率的に行う宿主細胞を創製するための技術開発を行うとともに、物質生産に有用な微生物遺伝資源を探索・整備することにより、バイオプロセスの技術基盤の確立を目指す。(JBAサイトより) |
| キーワード | 汎用的宿主細胞 | 宿主細胞創製技術 | 細胞モデリング技術 | 微生物遺伝資源ライブラリー |
| 特許(日本、海外) | JP20040599398 | JP20040113468 | PCT/JP2004/005162 | JP20040171548 | JP20040233562 | JP20040235414 | JP20040235918 | JP20040254446 | PCT/JP2004/016890 | PCT/JP2004/016891 | JP20040341706 | JP20040357556 | JP20040368166 | JP20040380940 | JP20050022196 | JP20050026723 | JP2005082420 |
| 成果物 (データベース、解析ツール) | アカシアESTデータベース | CADLIVE | GenoBase | MassBank | 予測プログラム |
