詳細情報 XML output
| 成果物名 | PMID-Extractor |
|---|---|
| 成果物の別名 | なし |
| 成果物に関する説明 | ユーザの手元にある論文ファイル群(PDFまたはテキスト形式)から、それらのPubMed ID (PMID)をリストとして取得するためのソフトです。文献チェックツールPubMedScan (http://medals.jp/pubmedscan/ ) を使う際に、自分の興味ある論文リストをPMIDによって入力しますが、そのリストの作成に利用できます。ファイルの1ページ目にあるDigital Object Identifiers (DOIs, http://ja.wikipedia.org/wiki/デジタルオブジェクト識別子)、 またはタイトル等のテキスト情報をもとに、NCBIに問い合わせて、PMIDを取得します。 |
| 成果物のタイプ | Tool |
| 運用機関 | バイオ産業情報化コンソーシアム|産業技術総合研究所 バイオメディシナル情報研究センター |
| 機関所在国 | 日本 |
| サイトURL | なし |
| インターフェイス | GUI |
| 入力例 | 左の入力ボックスでpdf,テキストのローカルファイルを選びます。または、右の入力ボックスに"diabetes"(糖尿病)などのキーワードをいれてPubMedデータの検索をします。 |
| キーワード |
PDF|PubMed ID (PMID)|Digital Object Identifier (DOI)
|
| ダウンロード先、ドキュメント |
[Web版]無し
[ローカル版]
プログラム一式 (zip)
|
| 使っている外部リソース | PubMed ID (PMID)|Digital Object Identifier (DOI) |
| 主な対象データ | 文献 |
| 生物種 |
なし
|
| 利用条件 | 表示 - クリエイティブ コモンズ |
| データ更新頻度 (過去2年間) | 1 |
| 最終更新日(調査日) | 2009/11/16 |
| 利用できるID | PMID|DOI |
| IDを使った成果物の利用方法 | なし |
| 外部リンク | なし |
| 論文等(PubMed ID) | なし |
| アーカイブ |
| プロジェクト名 | 統合データベースプロジェクト |
|---|---|
| 分野 | ゲノムインフォマティックス |
| 目的 | これまでに経済産業省関連機関により実施された研究開発プロジェクトの成果等を整備することにより、ライフサイエンス分野における研究開発の促進に資するデータベースを構築することを目的とします。 |
| 紹介 | 経済産業省からの委託を受け、経済産業省関連機関により実施されたライフサイエンス分野の研究開発プロジェクトの成果であるデータベースに関する情報提供サイトを構築・運用します。また、ヒト遺伝子に関連した各種研究成果に関しては、平成17~19年度に実施したゲノム情報統合プロジェクトにおいて構築した、ヒト全遺伝子のアノテーション統合データベース (H-Invitational DB: http://www.h-invitational.jp/) を基礎として、経済産業省関連の研究成果を連携して利用できるシステムを構築します。 |
| キーワード | デ-タベ-ス|解析ツ-ル|成果物|ポ-タル|統合 |
| 特許(日本、海外) | - |
| アーカイブ | |
| 成果物 (データベース、解析ツール) | H-DBAS | H-InvDB | リンク自動管理システム | ID一括変換システム | LEGENDA | MEDALS | PPI view | PubMedScan | VarySysDB |