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成果物名 DOGAN
成果物の別名 Database of Genome Analyzed at NITE
成果物に関する説明

DOGANは微生物の塩基配列データやORFなどの遺伝子情報、遺伝子地図、モチーフ情報、推定した遺伝子の根拠となる論文などの情報、プロテオーム解析結果を手に入れることができます。これらの情報は、アノテーターに確認されたものを公開しており、時間の経過に即して再アノテーションも行っている。また、Blastを用いた相同性検索サービスや、DNAクローンの発注サービスも行っています。
成果物のタイプ DB
運用機関 独立行政法人 製品評価技術基盤機構
機関所在国 日本
サイトURL http://www.bio.nite.go.jp/dogan/Top
インターフェイス GUI
入力例

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キーワード
Aspergillus oryzae RIB40 (黒麹菌) | Saccharomyces cerevisiae Kyokai no. 7 (清酒酵母) | Aeropyrum pernix K1 (好熱古細菌) | ...
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  • Aspergillus oryzae RIB40 (黒麹菌)
  • Saccharomyces cerevisiae Kyokai no. 7 (清酒酵母)
  • Aeropyrum pernix K1 (好熱古細菌)
  • Sulfolobus tokodaii strain 7 (好熱古細菌)
  • Methanocella paludicola SANAE (メタン生成古細菌)
  • Pyrococcus horikoshii OT3 (好熱古細菌)
  • Kitasatospora setae KM-6054 (抗生物質生産)
  • Rhodococcus opacus B4 (有機溶媒耐性)
  • Rhodococcus erythropolis PR4 (有機溶媒耐性)
  • Kocuria rhizophila DC2201 (有機溶媒耐性)
  • Microlunatus phosphovorus NM-1 (ポリリン酸蓄積菌)
  • Corynebacterium efficiens YS-314 (グルタミン酸生産菌)
  • Streptomyces avermitilis MA-4680 (抗生物質生産)
  • Anaerolinea thermophila UNI-1 (高温排水処理リアクター)
  • Deferribacter desulfuricans SSM1 (深海熱水噴出孔)
  • Staphylococcus haemolyticus JCSC1435 (ブドウ球菌(日和見感染性))
  • Staphylococcus aureus subsp. aureus MW2 (黄色ブドウ球菌(メチシリン耐性))
  • Staphylococcus aureus subsp. aureus N315 (黄色ブドウ球菌)
  • Brevibacillus brevis NBRC 100599 (タンパク質生産宿主)
  • Gemmatimonas aurantiaca T-27 (新門ジェマティモナデテス門)
  • Arthrospira platensis NIES-39 (スピルリナ)
  • Acetobacter pasteurianus IFO 3283-32 (酢酸菌)
  • Acidiphilium multivorum AIU301 (好酸性光合成細菌（好酸性、金属耐性）)
  • Sphingobium japonicum UT26S (ヘキサクロロシクロヘキサン分解)
  • Sphingobium sp. SYK-6 (リグニン分解)
  • Desulfovibrio magneticus RS-1 (磁性粒子合成金)
ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 80 | http://www.bio.nite.go.jp/dogan/DataDownload
使っている外部リソース PubMed | UniProt | InterPro | KEGG
主な対象データ DNA-配列 、プロテオーム
生物種
Aspergillus oryzae RIB40 | Saccharomyces cerevisiae Kyokai no. 7 | Aeropyrum pernix K1 | ...
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  • Aspergillus oryzae RIB40 [Taxonomy_id: 510516, コウジカビ]
  • Saccharomyces cerevisiae Kyokai no. 7 [Taxonomy_id: 721032, 出芽酵母]
  • Aeropyrum pernix K1 [Taxonomy_id: 272557]
  • Sulfolobus tokodaii strain 7 [Taxonomy_id: 273063]
  • Methanocella paludicola SANAE [Taxonomy_id: 304371]
  • Pyrococcus horikoshii OT3 [Taxonomy_id: 70601]
  • Kitasatospora setae KM-6054 [Taxonomy_id: 452652]
  • Rhodococcus opacus B4 [Taxonomy_id: 632772]
  • Rhodococcus erythropolis PR4 [Taxonomy_id: 234621]
  • Kocuria rhizophila DC2201 [Taxonomy_id: 378753]
  • Microlunatus phosphovorus NM-1 [Taxonomy_id: 1032480]
  • Corynebacterium efficiens YS-314 [Taxonomy_id: 196164, コリネ菌]
  • Streptomyces avermitilis MA-4680 [Taxonomy_id: 227882]
  • Anaerolinea thermophila UNI-1 [Taxonomy_id: 926569]
  • Deferribacter desulfuricans SSM1 [Taxonomy_id: 639282]
  • Staphylococcus haemolyticus JCSC1435 [Taxonomy_id: 279808, ブドウ球菌]
  • Staphylococcus aureus subsp. aureus MW2 [Taxonomy_id: 196620, 黄色ブドウ球菌]
  • Staphylococcus aureus subsp. aureus N315 [Taxonomy_id: 158879, 黄色ブドウ球菌]
  • Brevibacillus brevis NBRC 100599 [Taxonomy_id: 358681]
  • Gemmatimonas aurantiaca T-27 [Taxonomy_id: 379066]
  • Arthrospira platensis NIES-39 [Taxonomy_id: 696747, ラン藻]
  • Acetobacter pasteurianus IFO 3283-32 [Taxonomy_id: 634457]
  • Acidiphilium multivorum AIU301 [Taxonomy_id: 926570]
  • Sphingobium japonicum UT26S [Taxonomy_id: 452662]
  • Sphingobium sp. SYK-6 [Taxonomy_id: 627192]
  • Desulfovibrio magneticus RS-1 [Taxonomy_id: 573370]
  • Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240 [Taxonomy_id: 718274, チフス菌]
利用条件 なし
データ更新頻度 (過去2年間) 11
最終更新日（調査日） 2011/09/09 (2011/09/10)
利用できるID ORF_ID | NF_ID
IDを使った成果物の利用方法 http://www.bio.nite.go.jp/dogan/ProteinInformation?ORF_ID=[ORFID]
外部リンク

UniProt (http://www.uniprot.org/), HAMAP(http://www.expasy.org/sprot/hamap/), InterPro(http://www.ebi.ac.uk/interpro/), Pfam(http://pfam.sanger.ac.uk/), PROSITE(http://ca.expasy.org/prosite/), TIGRFAMs(http://www.jcvi.org/cms/research/projects/tigrfams/overview/), COG(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/COG/), MEROPS(http://merops.sanger.ac.uk/), TCDB(http://www.tcdb.org/), KEGG(http://www.genome.jp/kegg/), DDBJ(http://www.ddbj.nig.ac.jp/), NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/), EMBL(http://www.ebi.ac.uk/embl/), GOLD(http://www.genomesonline.org/), Genome project of Streptomyces avermitilis(http://avermitilis.ls.kitasato-u.ac.jp)
論文等（PubMed ID）

なし