詳細情報
| 成果物名 | MDV |
|---|---|
| 成果物の別名 | Motif Distribution Viewer |
| 成果物に関する説明 | Motif Distribution Viewer (MDV)は、プロモーター・モチーフの転写開始点（TSS)付近の位置分布を表示するツールです。プロモーター群をユーザーが指定できます（オリジナルサイトからの訳）。ツールはオリジナルサイトでも利用できますし、ダウンロードしてローカルマシンで利用することもできます。 |
| 成果物のタイプ | Tool |
| 運用機関 | 産業技術総合研究所 バイオメディシナル情報研究センター |
| 機関所在国 | 日本 |
| サイトURL | http://h-invitational.jp/mdv/ |
| インターフェイス | GUI |
| 入力例 | Step 1:遺伝子のセットを選択する。 Step 2:パラメーターをセットする。 Step 3:モチーフビューを選択し、4つのSubmitボタンのうち、該当するモチーフビューのボタンをクリックする。 |
| キーワード | cis-element|promoter|transcription start site (TSS)|２次元表示|マルチプルモチーフ|マイクロアレイ |
| ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 | 207 | http://h-invitational.jp/mdv/doc/download.html |
| 使っている外部リソース | H-InvDB | RefSeq | DBTSS | JASPAR |
| 主な対象データ | DNA-モチーフ |
| 生物種 | ヒト、マウスがサイト上で利用可能 |
| 利用条件 | 表示-継承 |
| データ更新頻度 (過去2年間) | 0 |
| 最終更新日（調査日） | 2008/09/20 (2009/09/29) |
| 利用できるID | HIX | RefSeq accession |
| IDを使った成果物の利用方法 | なし |
| 外部リンク | - |
| 論文等（PubMed ID） | なし |
| プロジェクト名 | ゲノム情報統合プロジェクト |
|---|---|
| 分野 | ゲノムインフォマティックス |
| 目的 | # ヒト遺伝子の完全なカタログを作成 # H-InvDBを基礎としたアノテーション技術開発 # 疾患、遺伝子発現、タンパク質間相互作用など情報統合 |
| 紹介 | 本プロジェクトは、経済産業省のモデル事業として平成17年度から平成19年度までの3年間にわたり、バイオ産業情報化コンソーシアムを中心としてその他6つの共同研究機関が実施した。ヒト完全長cDNAを詳細にアノテーション（注釈付け）したH-Invitational Database（H-InvDB）を基礎として、その構築のための技術をさらに高度化し、世界最高水準のヒト全遺伝子データベースを構築して公開した。 |
| キーワード | ゲノム｜遺伝子｜アノテーション｜統合｜データベース |
| 特許（日本、海外） | JP-2006-323830 | JP-2008-097189 |
| アーカイブ | |
| 成果物 (データベース、解析ツール) | Evola | G-compass | H-ANGEL | H-DBAS | H-Exp | H-InvDB | HEAT | LEGENDA | PPI view | TACT | VarySysDB |
