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関連プロジェクト

成果物名 TACT
成果物の別名 Transcriptome Auto-annotation Conducting Tool
成果物に関する説明 Transcriptome Auto-annotation Conducting Tool (TACT)は相同性検索(BLASTX, FASTY)、ORF予測、モチーフ検索解析(InterProScan)を統合し、真核生物遺伝子の機能を自動予測できる統合的自動アノテーションシステムです。TACTはH-Invitationalプロジェクトの一環として開発され、 ヒト遺伝子アノテーション統合データベースH-Invitational Database (H-InvDB)の構築・発展に貢献しています。
成果物のタイプ Tool
運用機関 産業技術総合研究所　バイオメディシナル情報研究センター
機関所在国 日本
サイトURL http://www.h-invitational.jp/tact/index_jp.html
インターフェイス GUI
入力例 画面上部中央のクエリー入力画面に塩基配列またはDDBJ accessionを入力して、「クエリ送信」ボタンを押してください。
キーワード 調査中
ダウンロードデータ総量（Mbyte） | データ一括取得方法 0.0 | なし
使っている外部リソース DDBJ/EMBL/GenBank | Ensembl | Gene ontology (GO) | H-InvDB | InterPro | RefSeq | UCSC | UniProt
主な対象データ DNA-配列
生物種 脊椎動物-哺乳類-ヒト ヒト以外の41生物種（http://h-invitational.jp/tact/species.html）
利用条件 表示-改変禁止 アカウント不要
データ更新頻度 (過去2年間) 9
最終更新日（調査日） 2008/03/03 (2008/10/06)
利用できるID Transcript ID (DDBJ accession for H-InvDB transcripts)
IDを使った成果物の利用方法 http://h-invitational.jp/tact/cgi-bin/tact.cgi?acc=[DDBJ accession]
外部リンク H-InvDB(http://www.h-invitational.jp/)
論文等（PubMed ID） 16845023 | Yamasaki C, Kawashima H, Todokoro F, Imamizu Y, Ogawa M, Tanino M, Itoh T, Gojobori T, and Imanishi T. TACT: Transcriptome Auto-annotation Conducting Tool of H-InvDB. Nucleic Acids Research 34 Web-server Issue: W345-W349 (2006).

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プロジェクト名 ゲノム情報統合プロジェクト
分野 ゲノムインフォマティックス
目的 # ヒト遺伝子の完全なカタログを作成 # H-InvDBを基礎としたアノテーション技術開発 # 疾患、遺伝子発現、タンパク質間相互作用など情報統合
紹介 本プロジェクトは、経済産業省のモデル事業として平成17年度から平成19年度までの3年間にわたり、バイオ産業情報化コンソーシアムを中心としてその他6つの共同研究機関が実施した。ヒト完全長cDNAを詳細にアノテーション（注釈付け）したH-Invitational Database（H-InvDB）を基礎として、その構築のための技術をさらに高度化し、世界最高水準のヒト全遺伝子データベースを構築して公開した。
キーワード ゲノム｜遺伝子｜アノテーション｜統合｜データベース
特許（日本、海外） JP-2006-323830 | JP-2008-097189
アーカイブ
平成17年度-19年度 ゲノム情報統合プロジェクト に関する報告書
成果物 (データベース、解析ツール) Evola | G-compass | H-ANGEL | H-DBAS | H-Exp | H-InvDB | HEAT | LEGENDA | MDV | PPI view | VarySysDB